Guido Wilhelmus Imbens sinh ngày 3 tháng 9 năm 1963 tại Geldrop, Hà Lan.[4] Năm 1975, gia đình anh chuyển đến Deurne, nơi anh theo học Peellandcollege (nl). Khi còn nhỏ, Imbens là một người chơi cờ ham mê.[5] Trong một cuộc phỏng vấn năm 2021, Imbens đã kết nối niềm đam mê kinh tế lượng của mình với niềm yêu thích thời thơ ấu của anh ấy đối với trò chơi.[6]